Највеће признање Музеју доделио је на Дан државности 15. фебруара 2021.године председник Републике, Сретењски орден трећег степена за нарочите заслуге за Републику Србију и њене грађане у области културе, а поводом 75 година постојања и успешног рада.
Следеће признање по важности које је додељено Музеју доделио је Топлички управни округ 2004. године за 55. година рада а то је ,, Светосавска повеља“ за ,, нарочит труд на просвећивању развоја духовности и ширењу опште културе, напор у откивању племенитог, великог и узвишеног свих српских тежњи ка добру, за чин стварања нових вредности нашег живота који обасјава пламен са Врачара“ .
Музеј је током седам деценија рада добијао и разна признања и захвалнице. Поменућемо само неке: